CLC and Bioedit

1.首先要用CLC MainWorkbench來對分段的sequence作連接

import5段sequence

 選擇上頭選項ToolBox中General sequence analyses> Join sequences

選擇要combine的sequences (sequence 1-5)

再進行排序

結果出來了~ 而且還附加restriction enzyme切的位置

將其export出FASTA檔案

 2.接著上NCBI查詢是否真的有blast到東西

於首頁點選blast功能頁面

選擇blastn(第一個)

把剛剛殂存之fasta檔匯入 點選於新視窗開啟

結果就出來嘞~ 最接近此條sequence的是human insulin (INS) mRNA 裡頭還有另外不同之相類似之結果

點選最為相接近之human insulin (INS) mRNA 可看出其blast, 並儲存FASTA檔案作為Bioedit用途

 3.BioEdit

開啟頁面

匯入由NCBI blast中儲存之檔案

開始工作~